Фонд рукописей — одно из богатейших в мире собраний письменных памятников отечественной и мировой культуры, от древних египетских папирусов до автографов наших современников. Он содержит свыше 430 тысяч единиц хранения, около 1.4 тысяч личных фондов и коллекционных собраний.
В фонде редких книг представлены книги кириллической печати с 1491 по 1800 гг., книги, напечатанные глаголическим шрифтом, книги гражданской печати первой четверти XVIII века, большая коллекция книг Петровской эпохи. Также в фонде хранятся инкунабулы (одна из крупнейших в мире коллекций), альдины, эльзевиры, западноевропейские издания XVI –XVII вв.
Фонд отдела картографии – второй по величине в России. По хронологическому охвату и репертуару изданий не имеет себе равных в стране. В составе фонда – карты, атласы, репродукции рукописных материалов, глобусы, электронные картографические издания. Свыше 100 тыс. экз. печатных изданий и около 200 ед. электронных карт и атласов.
Основной фонд изоизданий представляет собой собрание отечественных и иностранных документов в формате листовых изданий, альбомов и книг. В числе листовых изданий в фонде представлены – эстампы, фотографии, плакаты, репродукции и др. Свыше 1 млн 200 тыс. экз.
Уникальная фотографическая коллекция Отдела эстампов является подлинной летописью жизни России во второй половине XIX - начале XX в. Она включает фотопортреты с 1850–х гг., фотографические виды городов и отдельных местностей с 1850–х гг., фотографии различной тематики, фотографические репродукции художественных произведений.